מכיוון שמשאבת הבאר העמוקה המשמשת את היחידה פועלת ברציפות מדי יום, הגורמים לתקלות נפוצות מנותחות כדלקמן
משאבת הבאר העמוקה הטבולה אינה יכולה לשאוב מים או שהראש אינו מספיק:
א זה שופט כי המיסב של משאבת באר עמוקה ניזוק.
ב. לא ניתן להפעיל את המנוע; חסימת צנרת; קרע בצנרת; מסנן המים חסום; יציאת היניקה נמצאת מעל פני המים; המנוע מתהפך, טבעת האיטום של מעטפת המשאבה והאימפלר פגומים; הראש חורג יותר מדי מהראש המדורג של המשאבה הטבולה; האימפלר הפוך. לא ניתן להפעיל את המנוע; חסימת צנרת; קרע בצנרת; מסנן המים חסום; יציאת היניקה נמצאת מעל פני המים; המנוע מתהפך, טבעת האיטום של מעטפת המשאבה והאימפלר פגומים; הראש חורג יותר מדי מהראש המדורג של המשאבה הטבולה; האימפלר הפוך.
2. איטום לקוי: לאחר שימוש במנוע משאבת הבאר העמוקה במשך תקופה, חלקי האיטום דולפים שמן ומים עקב איטום לקוי שנגרם מבלאי או הזדקנות טבעית.
3. הזרם של משאבת הבאר העמוקה גדול מדי והמצביע של מד זרם מתנדנד
סיבה: טאטוא רוטור מנוע; הסיבוב היחסי של הציר והמיסב אינו גמיש; בשל הבלאי הרציני של מיסב הדחף, האימפלר וטבעת האיטום שחוקים; הציר כפוף והמיסב אינו קונצנטרי; מפלס המים הדינמי יורד מתחת לכניסת המים; העומק השקוע של האימפלר אינו מספיק, והרעידה נגרמת משאיפת אוויר; אום הדחיסה של האימפלר רופף.
פתרון בעיות: החלף את המיסב; החלף את מיסב הדחף או דיסק הדחף; חזור למפעל לתיקון.
4. צינור היציאה פגום ודלף: החלף את צינור היציאה או נקיטת אמצעי סתימה לשעת חירום. ניתן לשמוע את גלגל המשאבה של משאבת הבאר העמוקה התלויה בבאר העמוקה מסתובב כרגיל (גם המונה החשמלי מסתובב כרגיל), אך אין מים או רק כמות קטנה של מים. רוב זה נובע מכך שצינור היציאה ניזוק.
5. כשל בקבלים בהתנעה: החלף את הקבל מאותו מפרט. ניתן לשמוע צליל זמזום כאשר הכוח מחובר, אך המנוע של משאבת הבאר העמוקה אינו מסתובב; בשלב זה, אם מזיזים בעדינות את האימפלר ומשאבת הבאר העמוקה יכולה להסתובב מיד, ניתן לשפוט שהקיבול ניזוק.
6. חסימת משאבה: רוב האימפלרים של משאבת הבאר תקועים על ידי חומרים זרים. הברג את הבורג המרכזי של האימפלר, הוצא את האימפלר והסר חול, אבן וחומרים זרים אחרים. משאבת המים אינה מסתובבת, אך ניתן לשמוע צליל זמזום, אשר נובע בעיקר בגלל שאימפלר משאבת המים תקוע על ידי חומרים זרים. מסיבות גיאולוגיות, תכולת החול במי הבאר גדולה, מה שקל לגרום לנזק לכיסוי המסנן.
7. דליפה: זה נובע מדליפה של סלילה מנוע הנגרמת על ידי מים שנכנסים לגוף המשאבה של משאבת הבאר העמוקה. ניתן לעטוף אותו עם סרט עמיד למים לטיפול עמיד למים.