משאבות ביוב, המכונות גם משאבות שפכים, משמשות להובלת ביוב המכיל רכיבים אורגניים, אורגניים או מינרליים. משאבות ביוב הן בעיקר משאבות צנטריפוגליות בודדות - ואין להן יכולות ההתחלה של עצמי -. הם פועלים באמצעות אימפלר לצייר ושחרור ביוב ונועדו לעבוד שקוע במדיום המועבר. חותם פיר המשאבה משתמש בלאי - חותם פנים מכני עמיד.
בעת שימוש במשאבות ביוב שונות, אם אין כוח אדם ייעודי שיפקח עליהם, המשאבות חייבות לפעול על פי עקרון בקרת מפלס המים. אחרת, למשל, אם משאבת ביוב טבולה של WQ ממשיכה לרוץ לאחר ניקוז המים ולא מצליחה לעצור מייד, היעדר מי קירור עלול לגרום למנוע לשרוף. אם המשאבה תקלה ואיננה יכולה לכבות אוטומטית, הבעיה עלולה להחמיר.

עקרון בקרת מפלס המים של משאבות ביוב מסתמך בעיקר על חיישן מפלס צף כדי לשלוח אותות התחלה/עצירה ללוח הבקרה. הציפה קבועה בבריכה. לדוגמה, אם עומק הבריכה הוא 6 מטרים, מפלס המים הגבוה מוגדר מראש מוגדר על 5.5 מטר ומפלס המים הנמוך בגובה מטר. כאשר מפלס המים עולה לגובה 5.5 מטר, הציפה עולה עם המים ועומדת זקופה, ושולחת אות ללוח הבקרה כדי להתחיל את המשאבה. כאשר מפלס המים יורד לרמה המינימלית של מטר, הציפה נוטת כלפי מטה ושולחת אות ללוח הבקרה כדי לנתק את ההספק למשאבה. ללא קשר לשיטת בקרת מפלס המים המשמשת, העיקרון העובד של משאבות ביוב הוא למעשה זהה.
ניתן ליישם משאבות ביוב באופן נרחב בתעשיות כמו עיבוד מזון, בנייה, ייצור נייר, ייצור סוכר, עיבוד מתכות (למשל, אלקטרוליזה מתכתית), כריית ומיצוי משאבי מים (למשל, מי קירור, התפלה של מי ים). בהתאם לדרישות, ניתן לסווג משאבות ביוב למשאבות ביוב עירוניות ומשאבות ביוב תעשייתי. משאבות ביוב עירוניות משמשות בעיקר להובלת המדיומים הבאים: ביוב עירוני (למשל, ביוב מגורים, שפכים צואתיים), שפכים (למשל, מיכל משקעים ניקוי מים), בוצה (למשל, בוצה מופעלת, בוצה גולמית, בוצה מעוכלת ובוצה זרעים), מי גשמים.

בוצה מעוכלת מתייחסת לבוצה גולמית שעברה עיכול אנאירובי, ואילו בוצה זרעית מתייחסת לבוצה מופעלת חיצונית המשמשת להזמנת מערכת חדשה. עם זאת, עבור בוצה - כמו נוזלים, ראוי יותר להשתמש במשאבות slurry.