1. מאז ראש המשאבת סלור טבולהנמוך מדי וראש המשאבה גבוה ביותר מ-5 מטרים ממצב העבודה בפועל, הזרימה תהיה גדולה מדי והזרם יעלה. הפתרון הוא לסגור את שסתום היציאה של המשאבה הקטנה כדי להגביר את ההתנגדות. הפחת את זרם בקרת זרימת השקע.
2. יש לטבול את מנוע המשאבה הטבולה במים לשימוש. פיזור החום של המנוע הצולל מסתמך בעיקר על קירור מים. אם המנוע דולף מהמים ללא קירור מים, טמפרטורת המנוע תעלה בחדות, מה שיגרום בקלות למנוע להישרף.
3. אם הנוזל להובלה הוא מים חמים מתחת ל-80 מעלות, יש להשתמש במשאבה טבולה למים חמים. המשאבה הטבולה למים חמים היא בדרך כלל מוצר עם מעיל נירוסטה וקירור מי קירור חיצוני. מנוע קירור מי הברז בהחלט ישרף כי הטמפרטורה הבינונית גבוהה מכדי לקרר את המנוע.
4. מכיוון שהאטם המכני של המשאבה הטבולה פועל בסרק או מושחת מהנוזל, האיטם המכני נפגע, כך שגם המים במנוע יגרמו למנוע לבעור. ניתן להימנע מכך אם חיישן דליפת המים המתאים מותאם לארון הבקרה. תחזוקה שוטפת של אטמי החלפת משאבה צוללת אינה מומלצת עבור תצורה זו.
5. המנוע יישרף גם אם המנוע חסר בגלל סיבות מגע אחרות כגון כבל החשמל אינו במגע טוב.
עבור משאבות טבולות שהיו טבולות במים זמן רב, יש לבדוק את בידוד הקרקע ובידוד שלב לשלב של הסליל לפני הפעלת המנוע.
ניתן לבחור את משאבת המים עם הפונקציה של הגנה מפני דליפות ועומס יתר: משאבה טבולה עמידה בטמפרטורה גבוהה