באופן כללי, הגורמים העיקריים המשפיעים על הפעולה הרגילה של משאבות טבולות הם כדלקמן.
(1) בעיית דליפה. המאפיין של משאבה טבולה הוא שהמשאבה והמכונה משולבים ושקועים זה לזה, ולכן דליפה היא אחד הגורמים החשובים המשפיעים על הפעולה הרגילה של המשאבה הצוללת.
(2) סיבוב חסום. כאשר משאבה טבולה תקועה, זרם רוטור תקוע של 5-7 פעמים, זרם העומס המלא הרגיל ייוצר בסטטור המתפתל. ללא אמצעי מגן, המשאבה הצוללת תישרף במהירות. ישנן סיבות רבות לחסימה של משאבות טבולות, כגון פקוקי אימפלר, פסקיית חותם מכנית והסתבכות עפר.
(3) מתח אספקת החשמל נמוך מדי או שהתדר נמוך מדי.
(4) ללבוש וקורוזיה. בלאי יפחית מאוד את הביצועים של המשאבה החשמלית, וכתוצאה מכך ירידה בקצב הזרימה, הראש והיעילות. חלודה על אימפלר וכיסוי המשאבה יגרמו גם הם לעמוד. קורוזיה של רכיבי משאבה טבולים לא רק משפיעה על ביצועי המשאבה, אלא גם מקצרת את חיי השירות שלה.
(5) הכבל נשבר או שבור. שבירת כבלים ושבירה לא רק גורמים לתאונות זעזועים חשמליות, אלא גם גורמים לסביר להניח כי משאבת המים תהיה במצב עבודה דו-פאזי במהלך הפעולה, וכתוצאה מכך אין פריקת מים ונזק קל למנוע.